Comité Estratégico: Tiene un rol directivo, supervisor y decisor. Conformado por los miembros ordinarios propuestos por los firmantes del convenio. Dentro de sus funciones se encuentra velar por el cumplimiento de los objetivos propuestos, en el marco de sus principios y propósito general. También, aprobar las alianzas financieras, operativas y administrativas celebradas por la Unidad Operativa, y necesarias para el buen funcionamiento y la ampliación del campo de acción del Centro.

Comité Académico: Integrado por reconocidos miembros de la academia regional y nacional que serán los encargados de apoyar al Comité Estratégico como asesor de los estudios y opiniones adelantadas. Dentro de sus funciones se encuentra ofrecer su concepto técnico y académico, sobre las iniciativas que el Comité Estratégico tenga previsto para el desarrollo de las actividades del Centro. Así como apoyar al Centro y a su Unidad Operativa, en la construcción de alianzas académicas, que permitan tener un cuerpo de investigadores bajo la modalidad de asociados que puedan, ocasionalmente, desarrollar trabajos de investigación, estudios, análisis puntuales, o cualquier otro tipo de requerimiento académico.

Unidad Operativa: Tiene a su cargo el desarrollo de  la agenda temática, el plan de trabajo y el cumplimiento de los cronogramas de trabajo propuestos, en el marco de los principios y el propósito general del Centro. Será la encargada de adelantar las acciones necesarias para el logro de los objetivos del Centro desde los puntos de vista técnico, administrativo y financiero.